我國的公共衛生碩士在職研究生專業學位教育起步較晚，2000年初衛生部組織了《公共衛生專業學位培養方案》的論證;2001年國務院制定了《公共衛生專業學位試行辦法》;2002年在22所院校開展了公共衛生碩士在職研究生專業學位的試點工作，目前，試辦院校己增加到24所。經過近四年的試點，公共衛生碩士在職研究生專業學位的辦學規模不斷擴大，辦學質量穩步提高，據有關資料統計，到2004年全國共計招收公共衛生碩士在職研究生研究生2157人。

我國的公共衛生碩士在職研究生專業學位是為適應我國公共衛生事業發展需要而設立的，也是我國學位制度改革的重要組成部分。其主要培養目標是為我國衛生事業培養德智體全面發展的、高素質、高層次的公共衛生應用型專門人才。招收對象一般要求具有一定實踐經驗的從事公共衛生專業在職人員和有志于從事公共衛生事業的其他相關專業人員，采用理論學習、社會實踐和現場調查研究三結合的培養模式，培養年限一般為2-4年，實行學分制，開設課程以公共衛生與預防醫學一級學科范圍為主，其中，流行病學、衛生統計學、衛生事業管理等課程為必修。

學生在完成學位課程、獲得足夠的學分、完成社會實踐報告、撰寫學位論文并通過論文答辯后，可授予公共衛生碩士在職研究生專業學位。